Он назвал ее Особой канцелярией, во многих документах того времени ее еще называют Особенной канцелярией, а затем еще вывел ее из-под контроля Сената, отдав в лоно созданной им первой системы МВД России. Дело было не только в замене в последнем варианте канцелярии ее первоначального титула «Тайная» на «Особая», символизирующем прогресс в отношении к политическому сыску в Российской империи. Теперь это должен был быть не тайно-мистический страшный орган, а просто элемент бюрократической машины, занятый «особыми» делами деликатной сферы политической безопасности. Дело в том, что эта спецслужба даже после поверхностных реформ в ней Александра I уже отставала от требований времени, старела на глазах, все меньше защищала со своей стороны царскую власть в России. В этом смысле и переподчинение Особой канцелярии структуре МВД скорее еще более ослабляло эту романовскую спецслужбу в ее последней модификации. Многие страны прошли через эксперимент с объединением служб госбезопасности и обычной полиции в рамках одного централизованного ведомства, и сегодня почти везде этот опыт признан не самым лучшим — слишком разные задачи у политического сыска и борцов с уголовной преступностью. Разумеется, в России начала XIX века об этом мировом опыте еще не догадывались, император Александр Павлович просто искал место для своей спецслужбы в новых условиях Российской империи. Он даже при выделении из МВД отдельного министерства полиции отправит Особую канцелярию еще и туда, а в 1819 году с расформированием этого экспериментального ведомства вернет тайную полицию назад в структуру МВД — все эти рокировки Особую канцелярию тоже не усилили.
В целом Особая канцелярия при александровском МВД напоминает стареющего вояку, при своем огромном опыте прошлых битв отлично знающего, как надо бороться с врагами государства. Но вот беда, годы свое взяли, силы у ветерана уже не те, враги совсем не такие, как раньше, оружие поменялось (дыбу и топор у ветерана отобрало время и просвещенная власть). Его бы поблагодарить за службу и попросить словесно передать опыт новому молодому бойцу, но за старые заслуги и грудь в орденах его продолжают держать на службе. В некотором роде эта Особая канцелярия напоминает очень уже старого министра двора при последнем из Романовых Николае II — барона Фредерикса. Когда старик уже почти ничего не слышал и плохо идентифицировал собеседников, на все предложения отправить его на заслуженный отдых сентиментальный Николай Александрович Романов возмущенно восклицал: «Как можно! Ведь он мне так предан!» Если же подобрать сравнение из истории российских спецслужб, то александровская канцелярия заметно напоминает советский КГБ в конце эпохи Горбачева, когда заслуженный и могущественный колосс начал терять свое могущество на глазах. Особая канцелярия не просто последняя версия канцелярии Тайной, она в некотором роде переходный этап к новой спецслужбе романовского царства — к Третьему отделению. Просто этот переход непозволительно долго при Александре Павловиче затянулся, расплатой за это стал мятеж декабристов после его смерти.
Сев на трон своего отца Павла, убитого при молчаливом соучастии сына, новый император Александр 1 первым делом упразднил Тайную экспедицию. Но очень скоро он воссоздает спецслужбу под названием Особая канцелярия и без опеки над ней генерал-прокурора Сената. Это последняя страница истории Тайной канцелярии, век средневековых и пробных спецслужб в романовской Российской империи подходил к концу, а занял он действительно почти ровно век: с 1718-го по 1826 год.
Как водится, Александр начал правление с имиджем демократа и поборника справедливости, не допускающего и мысли о жестокости своего органа тайного сыска. При создании Особой канцелярии отдельным манифестом новый император объявил амнистию всем проходящим по политическому следствию упраздненной экспедиции, приложив их поименный список на целых четырех листах. В манифесте царя о ликвидации Тайной экспедиции от 2 апреля 1801 года есть даже радикальные строки об отказе от самой идеи централизованного политического сыска: «Мы признали за благо не только название, но и само действие Тайной экспедиции навсегда упразднить и уничтожить, повелевая все дела в оной бывшие отдать в государственный архив к вечному забвению». Эта наивная идея не прожила и года, предать забвению политический сыск в огромной Российской империи было уже нереально. Александр здесь только продекларировал желание пойти по стопам своего деда, Петра Федоровича, на настоящий эксперимент с очередной попыткой упразднения сыска он не решился.
И Особая канцелярия появилась на свет очень быстро после смелого обещания в манифесте 1801 года «предать саму идею забвению». И даже свое название последняя правопреемница Тайной канцелярии в части позамствовала у первой петровской канцелярии. Да и в плане методов преемственность была временами так заметна, что можно смело утверждать: с момента основания Петром I в 1718 году Тайной канцелярии до упразднения в 1826 году канцелярии Особой мы имеем дело с одним и тем же первым органом архаичной госбезопасности в Российской империи. Просто орган этот за сто с лишним лет работы модифицировался в зависимости от требований времени и императора, менял название, даже прерывал, как минимум, трижды свою деятельность, чтобы опять возродиться к жизни.
Новая структура почти ничем не отличалась от предшественницы павловских времен, только подчинялась уже не генерал-прокурору Сената, а созданному при императоре Александре Министерству внутренних дел, позднее — Министерству полиции. Возглавлял Особую канцелярию граф Яков Санглен, обрусевший француз. Затем его сменил наследник немецких баронов Максим Яковлевич (или Магнус Якобович) фон Фок, все начало XIX века политическим сыском в Российской империи доверяли руководить потомкам иностранцев на русской службе. В 1819 году Особую канцелярию по указу императора Александра перевели назад в структуру Министерства внутренних дел, понемногу из-за этого даже считать эту структуру полностью самостоятельной спецслужбой некоторым историкам стало трудно. Ее не только подчинили министру внутренних дел, чего сейчас в мире со спецслужбами практически не делают. В целом все ее положение в структуре силовых органов Российской империи при Александре I, весь вопрос ее подчиненности и подотчетности был довольно запутан. Значительно более запутан, чем у петровской или аннинской версий Тайной канцелярии. Те хотя бы были откровенным орудием в руках у самого российского самодержца безо всяких чиновно-министерских прослоек между ними, без вмешательств обер-прокурора и министра внутренних дел.
При Александре же впервые в российской истории Особой канцелярии были запрещены пытки при следствии по политическим делам, хотя иногда явочным порядком они и продолжали применяться. Отдельные филиалы Особой канцелярии помимо Петербурга существовали в других крупных имперских городах. К предмету деятельности Особой канцелярии, как было записано в императорском указе об ее создании, относились: деяния и речи против самодержавной власти, заговор, измена царю, «тайные скопища» (то есть подпольные общества и союзы любой политической направленности), разглашение государственной тайны и возмутительные речи.
В плане методов и уровня жесткости Особая канцелярия очень быстро отошла от наивных пожеланий царского манифеста от 2 апреля 1801 года и вернулась к уровню системы тайного сыска при свергнутом императоре Павле. Подвалы следственного ее отдела и Петропавловская крепость вскоре наполнились очередными государственными преступниками, в том числе из числа тех относительных либералов российской элиты, кто в первые годы правления молодого императора Александра составлял его опору и был сторонником либеральной реформы.