Отец Бориса рано умер. Бориса и его сестру Ирину взял в свою семью родной дядя Дмитрий Иванович, у которого свои дети умерли. Этот дядя, скромный вяземский помещик, попал в опричный корпус и ко двору царя Ивана Грозного, занял влиятельный пост постельничего, его племянник и племянница (ровесница царевича Федора) оказались в царских палатах, при дворе. Борис Годунов смог сполна использовать открывшиеся плодоносные возможности пребывания при царском дворе. Едва достигнув совершеннолетия, он надел опричный кафтан, служил стряпчим, за усердие был замечен, начались его карьерные успехи. Его сестра Ирина стала женой царевича, а затем царя Федора Ивановича, превосходила мужа по уму и была практичнее его, приобрела над ним большую власть. Это способствовало новым успехам в карьере Бориса Годунова.
Примерно в 20 лет (1572) Борис Годунов удостоверил подписью документ о пожертвовании родовой вотчины Годуновых в Ипатьевский монастырь (вотчина Годуновых граничила с монастырской территорией).
Со временем, став не только царским шурином (братом жены царя), но и первым помощником, самым доверенным лицом царя Федора Ивановича, Борис Годунов целых 14 лет (1584–1598) был реально (де-факто) первым правящим лицом в государстве, хотя де-юре первым был царь. Царица Ирина часто и неудачно была беременной, детей у царской четы не было.
Борис Годунов как человек с трезвой практической хваткой пытался помочь бездетной царской чете. Он решил обратиться к лучшим английским медикам за рекомендациями относительно бездетной царицы Ирины. Королева Англии Елизавета послала к русскому двору искусную, опытную повивальную бабку и доктора. Однако это получило преждевременную огласку, и в Москву был допущен только доктор. Годунов надеялся, что рождение наследника упрочит будущее царской династии и, следовательно, положение самих Годуновых при дворе. Помочь медицинскими средствами царской чете не удалось по объективным и субъективным причинам. Жизнеспособные дети в царской семье так и не родились, Борис Годунов оценил сложившуюся картину как знак свыше ему к борьбе за царский престол для него самого.
Эта ситуация давала Годуновым хрупкую надежду самим со временем официально приобрести царский статус. Это усилило их хлопоты по упрочению легенды об их высоком происхождении и долгой истории их рода, также усилило их внимание, пожертвования, помощь Ипатьевскому монастырю, монахи которого с выгодой для обители старались упрочить престиж Годуновых, в том числе они пытались доказать знатность их происхождения.
О существовании мурзы Чета, будто бы приехавшего на Русь в первой половине XIV в., говорится в единственном источнике – «Сказании о Чете». Но достоверность этого источника невелика, ведь составляли «Сказание» монахи тогда захолустного Ипатьевского монастыря. Со временем, когда Годуновы вспомнили, что Ипатьевский монастырь служил их родовой усыпальницей, появился шанс связать их происхождение с татарским князем Четом, якобы основателем этого монастыря. Сочиняя родословную сказку о Чете, монахи прежде всего стремились исторически обосновать княжеское происхождение Бориса Годунова и давнюю связь новой царской династии с Ипатьевским монастырем (Б.Ф. Годунов царствовал 7 лет, в 1598–1605 гг.). С научных позиций «Сказание о Чете» полно исторических несоответствий и не заслуживает доверия. Однако в памяти многих доверчивых потомков Ипатьевский монастырь остается истоком двух царских фамилий – Годуновых и Романовых (в 1613 г. в нем был призван на царство Михаил Романов). Почти вся остальная история этого монастыря меркнет в сравнении с этими двумя событиями.
Очень долго Ипатьевский монастырь был малоизвестен и небогат. Его прославление, обогащение, процветание начались только с возвышением семейства Годуновых во второй половине XVI в. и особенно после женитьбы царевича Федора Ивановича на Ирине Федоровне Годуновой, (которая часто и всегда неудачно была беременной). Детей у царской четы не было. А святой Ипатий Гангрский (епископ, священномученик, убит около 326 г., в его честь назван Ипатьевский монастырь) почитался на Руси– России прежде всего как «разрешитель спаситель от неплодства и бесчадия», существовала об этом особая молитва ему, не удивительно, что царская чета и Годуновы были особо щедрыми именно к этому монастырю, тем более, что он был еще связан с историей семейства Годуновых.
Ипатьевский монастырь. Святые ворота
Ипатьевский монастырь с конца XVI – начала XVII в. стал одним из известнейших и богатейших в России. Благодаря царским деньгам и подсказкам царственной чете Федору и Ирине, а также средствам боярского рода Годуновых, а потом личным средствам уже царя (с 1598 г.) Бориса Федоровича Годунова в Ипатьевском монастыре в небывалых масштабах развернулось каменное строительство и благоустроительные работы. В 1586 г. по повелению царя Федора Ивановича и его супруги Ирины Федоровны Годуновой были построены Святые ворота. С конца XVI в. в монастыре на средства Годуновых началось масштабное каменное строительство. В 1585–1590 гг. на средства Бориса Годунова и его дяди Дмитрия Годунова вокруг монастыря построили мощные крепостные стены протяженностью 500 м, высотой 6 м и шириной 3 м. Двери монастырского Троицкого собора были в конце XVI в. изготовлены на средства Дмитрия Годунова в технике огневого золочения по образцу медных дверей Успенского собора Московского Кремля. При одобрении и поддержке Годуновых были построены две надвратные церкви Федора Стратилата и Святой Ирины. В 1603–1605 гг. была построена монастырская звонница с 19 колоколами на средства Дмитрия Годунова. Годуновы подарили монастырскому Троицкому собору почти 90 икон, дарили ценные старинные книги, дорогую утварь, щедро жертвовали деньги на самые разные нужды обители. Уже царь Борис Федорович Годунов и его дядя Дмитрий Иванович делали многочисленные и дорогие вклады в монастырь, при их поддержке в обители была основана иконописная мастерская, налажена переписка древних летописей и книг. С начала XVII в. Ипатьевский монастырь стал одной из главных православных русских сокровищниц и крупным центром русской православной культуры.
В 1608 г. Ипатьевский монастырь захватили отряды Лжедмитрия II, которого называли «Тушинским вором». Они использовали монастырь как крепость для боевых действий на северо-востоке России. Ополчение северных городов (непокоренных Лжедмитрием II) во главе с костромичами в 1609 г. 6 месяцев осаждало монастырь, пытаясь выбить из него сторонников «Тушинского вора», что в конце концов удалось сделать. Крепость-монастырь была частично разрушена во время осады, восстановительные работы завершили только в 1621 г.
После того как поляков изгнали из Москвы и Земский собор выбрал в 1613 г. новым царем 17-летнего Михаила Федоровича Романова (1596–1645), крестным ходом посольство Земского собора: духовенство, бояре, воеводы, казаки, люди разного звания, отправились в костромской Ипатьевский монастырь, где тогда пребывали Михаил Романов и его мать инокиня Марфа (черкешенка Ксения Ивановна Шестова, владела богатой костромской вотчиной, умерла в 1631 г.). Посольство Земского собора прибыло из Москвы с чудотворной Владимирской иконой Божией Матери и Тихвинской иконой Богоматери древнего письма. К посольству Земского собора присоединилось Костромское посольство с чудотворной Феодоровской иконой Божией Матери. Крестным ходом объединенное посольство прибыло в Ипатьевский монастырь, где все члены этого посольства со слезами на глазах просили Михаила Романова принять царство, говорили о Божьей воле избрания его Самодержцем Всероссийским. Михаил боялся и не соглашался быть царем, не хотела отпускать его царствовать и его мать, ведь они знали трудные судьбы многих русских царей и особенно со страхом вспоминали судьбы царей отца и сына Годуновых, Василия Шуйского, самозванца Лжедмитрия. 6 часов уговаривали в Ипатьевском монастыре Михаила и его мать смириться с избранием юного боярина царем и принять царство. Говорили о том, что если Михаил не согласится царствовать, то Русская земля погибнет, за что Михаил и его мать будут отвечать перед Господом Богом. В конце концов инокиня Марфа согласилась отпустить сына царствовать и благословила его чудотворным образом Феодоровской Божией Матери, ставшим главным иконописным образом, родовой иконой царского семейства Романовых.
