28 сентября 1958 — Кароль Войтыла проходит обряд посвящения в епископы.
25 января 1959 — Папа Иоанн XXIII объявляет решение о созыве Второго Ватиканского Собора.
24 декабря 1959 — епископ Кароль Войтыла начинает служить праздничные рождественские мессы вне храма.
30 декабря 1959 — Войтыла представляет назначенной Папой комиссии по подготовке Ватикана II эссе о кризисе гуманизма.
16 июля 1962 — епископ Войтыла избирается исполняющим обязанности главы администрации Краковской епархии.
11 октября 1962 — начало работы Ватикана II.
7 ноября 1962 — выступление епископа Войтылы на Соборе по поводу литургической реформы.
21 ноября 1962 — Войтыла участвует в дебатах Собора о Богооткровении.
3 июня 1963 — кончина Папы Иоанна XXIII, наследником которого 21 июня провозглашается Павел VI.
Осень 1963 — епископ Войтыла активно участвует в дебатах Собора о Церкви как «Народе Божием».
Ноябрь 1963 — Войтыла публикует под псевдонимом в «Знаке» цикл стихотворений «Церковь», посвященный Ватикану II.
5—15 декабря 1963 — поездка Войтылы в Святую Землю.
30 декабря 1963 — Папа Павел VI назначает Кароля Войтылу архиепископом Краковским.
Март 1964 — архиепископ Войтыла по случаю своего вступления в должность выступает с пастырским посланием, делая в нем особый упор на свое понимание ответственности.
25 сентября 1964 — Войтыла призывает Ватикан II уделить больше внимания религиозной свободе.
8 октября 1964 — Войтыла принимает участие в разгоревшихся на Соборе дебатах о служении мирян.
21 октября 1964 — архиепископ Войтыла выступает на Соборе по вопросу о диалоге с современным миром.
8 декабря 1964 — Войтыла делает один из своих многочисленных докладов о II Ватиканском Соборе для краковчан в костеле Святой Марии.
Январь — апрель 1965 — архиепископ Войтыла работает в Арицци и Риме в подкомиссии по подготовке проекта документа II Ватиканского Собора «Церковь в современном мире».
Февраль 1965 — Войтыла публикует статью о Соборе в «Ты-годнике повшехны».
Апрель 1965 — архиепископ Войтыла делает более подробный разбор «изнутри» происходящего на Соборе в очередной статье, опубликованной в «Тыгоднике повшехны».
Июнь 1965 — Войтыла под псевдонимом публикует в «Знаке» новый поэтический цикл — «Святые места».
22 сентября 1965 — архиепископ Войтыла излагает на Соборе свой взгляд на проблему ответственности и религиозной свободы.
28 сентября 1965 — Войтыла выступает перед участниками II Ватиканского Собора с речью, посвященной христианскому подходу к «миру» и проблеме современного атеизма.
18 ноября 1965 — Польская и Немецкая Церкви обмениваются посланиями о примирении.
1969 — Польское теологическое общество публикует работу Войтылы «Личность и действие».
В начале августа 1958 г., в то самое время, когда его друзья Станислав и Данута Рыбицкие ожидали появления на свет своего первенца, отец Кароль Войтыла отправился на северо-восток Польши в двухнедельное «Шродовиско» — байдарочный поход по реке Лыне. В первый же день флотилия байдарок, собранная «адмиралом» Здзиславом Гейделем, проплыла миль пятнадцать или около того. На привале путешественники занялись каждый своим делом: отдыхали, играли в футбол, беседовали у разожженного на берегу костра. Гейдель оставил в Кракове четкое расписание похода, поэтому родственники, друзья и все желающие могли при необходимости отправлять его участникам письма на адрес почтовых отделений по маршруту следования. 5 августа, как раз в тот день, когда родился Станислав Рыбицкий-младший, Войтыла получил предписание срочно прибыть в Варшаву на доклад к Примасу Польши кардиналу Вышыньскому.
В путь отправились две байдарки: в одной Вуек (так называли Войтылу близкие друзья), во второй — Здзислав Гейдель и Габриель Туровский. Тот самый иммунолог Туровский, которого друзья прозвали Гапа [Болван], поскольку именно в такой роли он представал перед сотрудниками госбезопасности, регулярно вызывающими его для бесед после отказов от участия в ежегодной первомайской демонстрации. Троица довольно быстро добралась до места, где реку пересекала дорога, ведущая к ближайшей железнодорожной станции Олштынек. Пока Войтыла и Туровский прятали лодки под мостом, «адмирал» Гейдель отправился наверх и принялся «голосовать» едущим в сторону Олштынека машинам. Остановился грузовик, везущий молоко. Водитель согласился взять пассажиров, если те оплатят бензин. Вуек забрался в кузов и разместился среди бидонов. По прибытии на железнодорожную станцию он первым делом отправился в туалет, где переоделся в сутану и, как вспоминает Туровский, «вышел из мужской комнаты вновь в обличье священника».
Кардинал Вышыньский сообщил представшему пред ним отцу Каролю Войтыле ошеломляющую новость: 4 июля Папа Пий XII присвоил ему титул епископа Омбийского и назначил помощником архиепископа Бажака, апостольского администратора Краковского архиепископства. Войтыла, словно во сне произнеся положенные в таких случаях слова о готовности принять сан, вышел из кабинета Примаса и направился прямо в расположенный неподалеку монастырь урсулинок. Постучав в дверь обители, он тихо попросил открывших ему сестер отвести его куда-нибудь, где можно спокойно помолиться. Сестры, хотя и не знали Войтылу, выполнили его просьбу незамедлительно — видимо, роль пропуска сыграла сутана незнакомца. Но, проводив его в часовню и оставив одного, монахини через некоторое время на всякий случай вернулись и заглянули внутрь, чтобы узнать, что там происходит. Священник, распростершийся перед дарохранительницей, почти не шевелился. Подумав, что он исполняет какую-то возложенную на него епитимью, сестры решили не мешать. Но и вернувшись через несколько часов, они увидели Войтылу распростертого в той же позе перед Святыми Дарами.
— Уже довольно поздно, — решилась прервать молитву одна из сестер. — Может быть, отец хочет поужинать?
— Не беспокойтесь, — ответил незнакомый священник. — Мой поезд до Кракова отходит после полуночи. Позвольте мне еще побыть здесь. Мне необходимо очень о многом поговорить с Господом…
Но беседовать с Богом вечно было нельзя, отцу Войтыле следовало торопиться на встречу с архиепископом Бажаком, которому, судя по всему, было много чего сказать новому епископу. Встретившись с ним, Войтыла попросил дать ему еще немного времени, чтобы вернуться на реку и отслужить воскресную мессу для своих друзей. Гейдель и Туровский встретили его в том же месте — у моста, где останавливался грузовик, подвозивший их до Олштынека. И в лагерь они поплыли на тех же байдарках. Ошеломленные новостью о высоком назначении Войтылы, друзья даже не знали, как его теперь следует называть.
— Не волнуйтесь, — успокоил он их, — Вуек всегда останется Вуеком.