Огромные потери, нанесенные японской армии защитниками Порт-Артура, вынудили Ноги отказаться от атак северо-восточного участка крепости и принять решение захватить Высокую, оборудовать там наблюдательные пункты и уничтожить русскую эскадру огнем своей артиллерии. После двухдневного непрерывного артиллерийского обстрела против десяти рот неполного состава (от 60 до 140 человек в каждой), оборонявших Высокую и Плоскую, японское командование бросило 15 ноября в бой 1-ю пехотную дивизию, резервный полк и два батальона 7-й дивизии. В течение девяти дней значительно превосходящие силы японской пехоты непрерывно атаковали позиции русских на высотах. Уже после двух дней боев японское командование было вынуждено сменить из-за больших потерь 1-ю дивизию 7-й пехотной. Под прикрытием огня батарей крепости защитники высот мужественно отражали натиск врага. Однако силы были настолько неравными, что к вечеру 22 ноября противнику удалось захватить Высокую.
Схема 29. Сапные работы японцев против горы Высокая в ноябре — декабре 1904 г.
Учитывая важное тактическое значение Высокой, генерал Кондратенко с большим трудом собрал несколько рот с неатакованных участков крепости и отдал распоряжение выбить противника с высоты. Одновременно он обратился к Стесселю с просьбой выслать подкрепления, но тот отказал ему в этом. Под командованием полковника Ирмана собранные Р.И. Кондратенко роты перешли в решительную контратаку и выбили японцев с одной из вершин Высокой. Но полностью очистить Высокую не удалось: слишком мало было для этого сил. Вскоре истощенные в непрерывных многодневных боях русские войска оставили передовые позиции западного фронта и отошли на основную линию обороны. Дорогой ценой досталась японцам Высокая: они потеряли здесь около 12 тыс. солдат и офицеров.
На второй день после захвата Высокой японцы оборудовали там наблюдательные пункты и стали вести прицельный огонь из 11-дюймовых гаубиц по хорошо наблюдаемым с высоты кораблям эскадры, стоявшим на внутреннем рейде. Положение эскадры стало гибельным. Необходимо было срочно выйти на внешний рейд, занять выгодное положение и дать бой кораблям противника или интернироваться в китайских портах. Однако командовавший в то время отрядом крейсеров контр-адмирал Вирен бездействовал, что и привело к окончательной гибели эскадры.
2 декабря в 20 ч 15 мин в каземат форта № II попал японский 11-дюймовый снаряд. Свод каземата был пробит, и снаряд разорвался в его внутреннем помещении. Погибли герои обороны генерал-майор Роман Исидорович Кондратенко и вместе с ним еще восемь офицеров, в том числе полковник Генерального штаба Науменко и военный инженер полковник Рашевский. Гибель Кондратенко, которого справедливо называли душой обороны крепости, серьезно отразилась на моральном состоянии защитников Порт-Артура.
Во второй половине дня 5 декабря 1904 г. японцы произвели три взрыва под бруствером форта № II. От сильных взрывов средняя часть бруствера обрушилась, образовав глубокую воронку. Одновременно японская артиллерия сосредоточила огонь по соседним укреплениям и траншеям вблизи форта. Под прикрытием огня артиллерии японская пехота двинулась в наступление. Когда пехота противника приблизилась к образованной взрывом воронке, она попала под перекрестный огонь крепостных батарей. С фронта защитники форта поражали штурмующих картечным огнем из двух противоштурмовых орудий, ружейно-пулеметным огнем, забрасывали их ручными гранатами. Очутившись под многослойным перекрестным огнем русских, японские солдаты залегли. Бой длился несколько часов. Неоднократные попытки противника ворваться внутрь форта неизменно отражались артиллерийским и ружейно-пулеметным огнем защитников. Понеся большие потери, вечером остатки японского полка отошли
В то время, когда защитники форта отбивали ожесточенную атаку японцев, назначенный начальником сухопутной обороны крепости генерал Фок решил сдать форт № II противнику. Заручившись согласием Стесселя, он по телефону сообщил об этом генералу Горбатовскому, который ответил, что он будет удерживать форт до последней возможности. Пока Горбатовский принимал меры к усилению гарнизона форта, Фок передал приказание о сдаче непосредственно его коменданту. Солдаты и офицеры форта спешно эвакуировали раненых, вывезли имущество, заминировали и после этого взорвали форт. К большому разочарованию Фока, японцам вместо укрепления досталась груда развалин.
Остатки гарнизона форта отошли к Куропаткинскому люнету и стали здесь оборудовать траншею, с тем чтобы не дать противнику возможности захватить люнет. Но это также не входило в расчеты Фока: он продолжал ослаблять оборону крепости. Фок сообщил Горбатовскому: «Куропаткинский люнет я не хотел бы занимать сильнее, чем он был занят до настоящего времени. Даже склоняюсь к тому, чтобы его занять слабее, так как нам придется все равно очистить вскоре люнет. Все дело в том, чтобы выиграть время, а потому уменьшить потери…» [56. Т. 8. С. 661].
После падения форта № II основные усилия японцы сосредоточили против форта № III и укрепления № 3. Против форта № III японские саперы продолжали прокладывать три подземные галереи. Защитникам форта взрывами шаровых мин и метанием мин из минных мортир удалось разрушить часть подходов к форту, но воспрепятствовать ведению галерей не представлялось возможным. Не увенчались успехом и контрминные работы. Утром 15 декабря противник произвел 12 подземных взрывов и превратил форт в груду развалин. От взрыва погибла половина гарнизона и была выведена из строя большая часть орудий.
После двухчасового артобстрела два полка японской пехоты двинулись в атаку. Несмотря на большие потери в личном составе и материальной части, остатки гарнизона форта № III встретили противника сильным ружейно-артиллерийским огнем. В бой вступили расчеты противоштурмовых орудий под командованием поручика Данилова. Картечным огнем в упор сметались цепь за цепью, и японцы были вынуждены залечь. Чтобы помочь своей пехоте, японская артиллерия открыла ураганный огонь, в результате чего были повреждены все уцелевшие штурмовые орудия форта № III. Воспользовавшись этим, японцы снова ринулись в атаку и захватили весь бруствер форта. Генерал Горбатовский усилил гарнизон форта несколькими ротами из резерва, и бой закипел с новой силой. 11 ч русские солдаты и офицеры упорно защищали развалины форта от значительно превосходящих сил противника. Когда японские части почти окружили форт, поступил приказ оставить его. Небольшая группа солдат под командованием находившегося там с начала осады коменданта форта капитана Булгакова подожгла деревянные части укрепления и отошла.
19 декабря после интенсивного артобстрела японцы атаковали русскую позицию Орлиное гнездо — ключевую позицию 2-й линии обороны. Русские встретили пехоту противника картечью, но японцам удалось все-таки дойти до укрепления. Завязался рукопашный бой, из 70 русских солдат осталось только 6, но японцы бежали. Орлиное гнездо было занято подошедшим подкреплением русских солдат и ротой моряков. Этими силами были отбиты пять последующих атак японской пехоты.
Вместо посылки новых резервов Фок, минуя непосредственного начальника Орлиного гнезда Горбатовского, отдал приказ об оставлении Орлиного гнезда, Куропаткинского люнета и Китайской стенки.